新一代测序中,基因从头测序和重测序有什么区别?我要做乙肝病毒

fjmyhfvclm2025-01-15  5

那年丶人已散尽的回答:


1、条件不同

从头测序的条件是不依赖于任何物种基因组;重测序的条件是在已知物种基因组的情况下进行的。

2、病毒变异率不同

从头测序是通过拼接和组装的方式获得基因组序列图谱,病毒变异率很低;重测序可以寻找出大量的单核苷酸多型性位点,插入缺失位点,结构变异位点,拷贝数变异等变异资讯,从而获得生物群体的遗传特徵。病毒变异率很高。

乙肝病毒在医学上已经测过,只需要做重测序就可以。

热心网友的回答:


从头测序是目前为止还没有人测过那个物种的全基因组,没有参考序列进行比对,需要自己组装拼接后才能知道序列;而重测序是已经有人测过了,只需要重新测序,有参考序列了,只需要与参考序列比对。

乙肝病毒好像是已经测过的,只需要做重测序就可以!

美吉生物的回答:


基因从头测序也叫做基因de novo测序,是指不依赖于任何已知基因组序列资讯对某个物种的基因组进行测序,然后应用生物资讯学手段对测序序列进行拼接和组装,最终获得该物种基因组序列图谱。

重测序是指在已知物种基因组的情况下,对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序,可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法,可以寻找出大量的单核苷酸多型性位点(snp),插入缺失位点(indel,insertion deletion),结构变异位点(sv,structure variation),拷贝数变异(copy number variation,**v)等变异资讯,从而获得生物群体的遗传特徵。

病毒变异率很高,一般不用重测序,可以用de novo从头测序。

热心网友的回答:


专业性东西,自己看看这个

资料

全基因组重测序和基因组测序有什么区别

热心网友的回答:


没什么区别吧。习惯说法的关係。是全基因组测序和重测序有点不同。

dna 的 1代测序,2代测序,3代测序的区别是什么啊?

垠元的回答:


第一代测序:指双脱氧末端终止法,扩增后通过毛细管电泳读取序列,每次获取资料量少。

第二代测序:为高通量测序,採用微珠或高密度晶片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数g资料,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大讯号,扩增后再检测。

第三代测序:特点是单分子测序,多基于奈米科技,无需扩增,对单分链dna/rna直接用合成、降解、通过奈米孔等方式直接测序,核心特点是无需扩增所以成本更低。

热心网友的回答:


你说的1代2代指的是子代1代,2代吗?原本的双链dna就是亲代,以亲本为模板複製产生的子代dna就是子1代,子2代.....

什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗

邂逅的回答:


「普通的基因测序」应该

是指「常规dna测序」吧,是用sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。

高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2023年的时候,3700、megabace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。

不过到2023年以后,高通量测序就改指第二代测序(next generation sequencing),454、solexa(后改为illumina)和solid等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。

ngs的特点主要有:

1、通量高。一个run能产生500mb-600gb的资料量。

2、读长相对较短。454(约400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。

3、单位资料的成本非常低。现在很多专案测序的费用。已经非常低。生物资讯分析成本变得更为重要了。

简化基因组测序和基因组测序的区别

热心网友的回答:


一、16s测序原理16srdna基因存在于所有细菌的基因组中,具有高度保守性。然而该基因序列还包括9个高变区(v1-v9),通过特异性引物对某一段高变区(如v3区)或某几段高变区(如v3-v4区)进行扩增测序,然后与资料库比对,可特异性识别细菌种类。

二、巨集基因组测序原理将基因组dna随机打断成若干条500bp的小片段(类似于拼图中的单个形状不一的模组),然后连线接头(双端120bp),在片段两端加通用引物进行pcr扩增测序。将reads进行组装拼接(类似于将众多模组拼成一副完整**),得到基因序列,众多基因构成完整的基因集。同时将获得的reads片段或组装好的基因序列与ncbi资料库进行比对,得到物种注释结果。

对于16s测序而言,任何一个高变区或几个高变区,儘管变异性再高,对于某些物种来说,这些高变区也可能十分相近,而能够区分它们的特异性序列片段有可能不在我们的扩增区域内。换言之,非全长的可变区序列覆盖範围不够导致无法鉴定到种。巨集基因组在建库之前会先将基因组dna随机打断成若干小片段,而这些小片段中总有一些能够包含区分2个物种的基因差异序列。

由于测序深度足够深,相当于覆盖了整个基因组的资讯,因此在与ncbi资料库比对时,就能够注释到相应的种水平的物种。

什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗?

热心网友的回答:


「普通的基因测序」应该是指「常规dna测序」吧,是用sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。

高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2023年的时候,3700、megabace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。

不过到2023年以后,高通量测序就改指第二代测序(next generation sequencing),454、solexa(后改为illumina)和solid等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。

ngs的特点主要有:

1、通量高,一个run能产生500mb-600gb的资料量

2、读长相对较短,454(约400-500bp), illumina(100-250bp),solid(75-100)

3、单位资料的成本非常低,现在很多专案测序的费用,已经非常低,生物资讯分析成本变得更为重要了。

美吉生物的回答:


普通的基因测序即常规测序,高通量测序技术(

high-throughput sequencing)又称「下一代」测序技术("next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条dna分子进行序列测定和一般读长较短等为标誌。

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条dna分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细緻全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deepsequencing)。

全基因测序和一般基因检测的区别

北京索莱宝科技****的回答:


基因测序是测出dna上的硷基是a,c,g,t中的哪一个;

而基因检测是通过杂交或测序等方法来确定dna序列中是否含有特定的一段序列,来明确相关的基因某些功能。比如耳聋基因检测就是用晶片来检测一个正常人是否携带隐性先天性耳聋基因或者药敏性耳聋基因。

测序只是得到dna的序列,而检测是最终要跟功能建立联络。

金英杰教育的回答:


基因检测的作用就在于此:它可以先判定某人的cyp2c9是否发生了突变,并判定他属于哪种代谢型别,然后再根据代谢型别决定药物剂量。

如果是强代谢型,那就适当提高剂量;如果是弱代谢型,那就降低剂量并注意药物在血液中的含量。这样就既保证了药物达到**效果,也不会出现adr。

一般基因检测只是对某一个或几个基因或者某一个基因上特定片段或者特定位点的硷基对测序。

全基因测序是指一个生物体携带的所有基因资讯测序,包括所有染色体上所有基因和非基因的硷基对测序,线粒体核糖体上的硷基对测序。

基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术 。

基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,**罹患多种疾病的可能性,个体的行为特徵及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等  。

徵求帮助的回答:


全基因测序是指一个生物体携带的所有基因资讯测序,包括所有染色体上所有基因和非基因的硷基对测序,线粒体核糖体上的硷基对测序。

一般基因检测只是对某一个或几个基因或者某一个基因上特定片段或者特定位点的硷基对测序

卫丰心理说客的回答:


全基因测序:

无重点的 对人体30亿个硷基进行全部测序。检测内容多,这样势必单价高,价效比低。钱多任性的选择。

一般基因检测:

有重点、有选择的进行检测基因硷基顺序,根据个人明确的目的和需求,比如肿瘤易感性,心脑血管易感性、靶向用药前检测等等。针对性强,检测的内容相对明确且偏少。这样可以增加检测的价效比,较为实用。

基谱生物为您解答。

rna测序与整个基因组测序相比有什么优势

加菲熊猫的回答:


朋友你好!

虽然rna种类多样,但我们拿来测序的一般是信使rna即mrna。众所周知mrna是核内基因表达时通过转录修饰后的产物,其直接通过招募核糖体结合trna进行翻译表达。因此相比于dna,mrna上既没有複杂庞大的非表达dna部分(这类dna元件不会转录出mrna),也不含内含子等表达基因的冗余部分,可以说mrna是最接近所表达的蛋白产物的模板了。

因此rna测序直观,简洁,高效的反映了某一时刻生物体蛋白质的表达水平,具有简洁性和时效性。

希望帮到你,欢迎追问~

手机使用者的回答:


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rna-seq助力遗传疾病诊断

菅勃纪曼安的回答:


rna测序也就是所谓的rna-seq,通常指的是转录组测序,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。

而基因组测序是整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。

这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个是测基因组,它们的不同就是转录组和基因组的不同。至于优势,根据自己的目的来判断吧。

欢迎追问。

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