热心网友的回答：
编码同一氨基酸的不同密码子称为同义密码，其差别仅在密码子的第3位硷基不同。
不同种属间使用同义密码的频率有很大差异，如人类基因中，丙氨酸（ale）密码子多为gca,gcc或gct,而gcg很少使用。
密码子偏好性研究5
热心网友的回答：
不同的生物，甚至同种生物不同的蛋白质编码基因，对简併密码子使用频率并不相同，具有一定的偏爱性，其决定因素是：生物基因组中的硷基含量 在富含at的生物（如单链dna噬菌体fx174）基因组中，密码子第三位上的u和a出现的频率较高；而在gc 丰富的生物（如链霉菌）基因组中，第三位上含有g或c的简併密码子佔90%以上的绝对优势。已知dnag和rpod（编码rna聚合酶亚基）及rpsu（30s核糖体上的s21б蛋白）属于大肠桿菌基因组上的同一个操纵子，而这3个基因产物在数量上却大不相同，每个细胞内仅有dnag产物50拷贝，而rpod为2800拷贝，rpsu则高达40 000拷贝之多。
研究dnag序列发现其中含有不少稀有密码子，也就是说这些密码子在其他基因中利用频率很低，而在dnag中却很高。许多调控蛋白如laci、arac、trpr等在细胞内含量也很低，编码这些蛋白的基因中密码子的使用频率和dnag相似，而明显不同于非调节蛋白。高频率使用这些密码子的基因翻译过程极容易受阻，影响了蛋白质合成的总量。
细胞内对应于稀有密码子的trna较少，高频率使用这些密码子的基因翻译过程容易受阻，影响了蛋白质合成的总量。
如何在ncbi中查基因密码子偏好性
热心网友的回答：
ncbi没有这样的资料，你可以在codonusagedatabase查到相关物种的密码子偏好资讯。
codonusagedatabase资料库用以计算密码子偏好的序列资料都是来自ncbi，也是学术界和工业界经常使用的资料库。该资料库是用物种名索引的。使用之前必须首先搞清楚你所研究物种的拉丁名（例如 homo sapiens）。
也可按字母浏览。不过在检索方式上，该资料库不象其他的生物资讯学资料库那么灵活，其对检索词要求比较严格。可能的原因是有些物种的拉丁名非常相似（例如只差一个数字），如果出差错的话，就是「差之毫釐 谬以千里」。
因此，反覆核对物种名应该是使用该资料库最重要的步骤。
如果要计算单个或一组基因可以用其提供的countcodon的服务
什么是生物体密码子偏爱性？
学无止境的回答：
遗传资讯在由mrna到蛋白质的传递过程中是以三联体密码子的形式传递的。每种氨基酸至少对应一个密码子，最多的有6种对应的密码子。编码同一种氨基酸的密码子称为同义密码子。
在蛋白质的合成过程中，同义密码子的使用概率并不相同。某一物种或某一基因通常倾向于使用一种或几种特定的同义密码子，这些密码子被称为最优密码子(optimal codon)，此现象被称为密码子偏爱性(codon usage bias)。
归山狼的回答：
有些氨基酸会有多个密码子，在进行蛋白质合成过程中，并不是所有的负载trna都能和mrna互补结合运载氨基酸，而是这些trna中的几个会参与蛋白质的合成过程。这就是所谓的偏爱性。
希望你满意。
主要有以下区别。1 位置 不同。密码子存在于mrna上，是mrna上由三个相邻硷基组成的一组三联体，每一组都只代表一种氨基酸。而反密码子存在于trna上，可与mrna中的三联体密码子形成硷基配对的三个相邻硷基。2 作用不同。密码子的作用是在蛋白质合成时确定在蛋白质肽链中的哪个位置是哪种氨基酸。而反密...
同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简併性 degeneracy 密码子简併性具有重要的生物学意义,它可以减少有害突变.简併性使得那些即使密码子中硷基被改变,仍然能编码原来氨基酸的可能性大为提高.密码的简併也使dna分子上硷基组成有较大余地的变动,例如细菌dna中g c含量变动很大,...
1 方向性，密码子是对mrna分子的硷基序列而言的，它的阅读方向是与mrna的合成方向或mrna编码方向一致的，即从5 端至3 端。2 连续性，mrna的读码方向从5 端至3 端方向，两个密码子之间无任何核苷酸隔开。mrna链上硷基的插入 缺失和重叠，均造成框移突变。3 简併性，指一个氨基酸具有两个...
