全了！最新真核生物rRNA和ITS物种分类数据库，来咯！

在生物学的广袤领域中，真核生物的研究一直是重难点。从微小的原生生物到复杂的动植物，真核生物的多样性令人惊叹，但准确识别和分类它们却犹如大海捞针。今天，小编要向大家介绍一款专为真核生物扩增子研究打造的强大工具—— EUKARYOME 数据库。该数据库是针对所有真核生物核糖体18S rRNA、28S rRNA和内源转录间隔区（ITS）标记的参考数据库，对真核生物的分类鉴定等研究具有重要意义。

该数据库可访问地址：http://www.eukaryome.org。

EUKARYOME 数据库的优势

1. 全面的标记覆盖：该数据库特别有助于识别丛枝菌根真菌，因为它连接了四个常用的分子标记——ITS1、ITS2、18S V4-V5和28S D1-D2亚区域。与其他注释参考序列数据库相比，该数据库的主要优势在于它不局限于某些分类群，并且包含所有rRNA标记。无论是研究真菌、植物、原生生物还是动物，都可以在该数据库中找到对应的参考序列，在分类覆盖上超过其他数据库。

2. 长读长数据优势：EUKARYOME还提供了一些参考长读序列，这些序列源自（元）基因组和（元）条形码，这一独特特征可用于第三代长读高通量测序数据的分类鉴定和嵌合体控制。

3. 严格的数据处理与质量控制：从数据收集到整合，每一步都经过严格把关。通过多重筛选和比对，去除冗余、低质量和嵌合序列，确保数据的准确性和可靠性。

EUKARYOME 数据库的使用方式

• 访问便捷：用户可以轻松访问数据库主页（http://www.eukaryome.org），根据自己的需求选择不同格式的数据集，无论是进行常规分析还是定制化研究，都能找到合适的数据资源。

• 数据灵活运用：数据库提供了多种数据格式，可与常见的生物信息学平台无缝对接，如 QIIME2、mothur 等，方便研究人员进行序列识别、嵌合体过滤和系统发育分析。

EUKARYOME 数据库的发展潜力巨大。未来随着新的长读长序列数据不断积累，以及相关源数据库的持续更新，它将不断扩充和完善。未来，它将不仅在分类鉴定方面更加精准，还将拓展到更多标记的整合，为真核生物的研究提供更全面、深入的支持。

参考文献

EUKARYOME: the rRNA gene reference database for identification of all eukaryotes. Database, 2024.